Si estás usando la herramienta Kdiff3 ya sea con SVN o con Git como es mi caso, es bastante molesto que cuando haces merge de algún archivo con conflicto te crea unos archivos .orig que luego aparecen como nuevos y tienes que descargar en Git.

Mediante la interfaz gráfica puede desactivarse la creación de estos archivos de copia (o situarlos en otra carpeta si lo ves necesario). Para ello abre Kdiff3 y dirígete al menú Preferencias > Configurar Kdiff3...



En la pestaña Carpeta encontraremos varias opciones, la última opción nos permite desactivar los archivos de copias de respaldo (.orig), desactivándola ya no nos creará estos archivos.